En verano de 1903, pasó a disputar sus partidos como local en el Velódromo de la Calle Aragón, aunque el paso por este recinto fue efímero. Ese mismo verano también llegó al Athletic el prometedor centrocampista Ander Herrera, proveniente del Real Zaragoza, a quien el Athletic llevaba años intentando fichar. El escudo del Real Madrid es una de las marcas deportivas más prestigiosas. El Madrid se había fijado en un delantero que había destacado en Ferencvaros y Vasas, y su intención fue firmarlo lo antes posible. Allí proyectó un ‘mapping’ en el que se pudo ver a algunos jugadores luciendo ambas vestimentas. Fue uno de los emblemas, junto a Pirri, Grosso, Zoco o Velázquez, del Madrid ye-ye, el único equipo de la historia que ha ganado la Copa de Europa con todos los jugadores del mismo país. Son numerosos los desplazamientos para animar al equipo tanto en los desplazamientos por España, como por Europa.
En agosto de 2015 se enfrentó al F. C. Barcelona por el título de la Supercopa de España gracias a su subcampeonato de Copa y a que el Barcelona fue campeón tanto de Liga como de Copa. Esa temporada el Athletic cayó en octavos de final de la Copa de la UEFA a manos del Parma, tras haber eliminado a un rival complicado como el Newcastle. Por un lado, logró una goleada histórica en la Copa de la UEFA al ganar por 1-7 al Standard Lieja, cayendo después eliminado en dieciseisavos ante el Austria de Viena. Gracias a esa final, el Athletic se clasificó para disputar la nueva Europa League (versión renovada de la Copa de la UEFA) y para jugar la Supercopa de España contra el propio F. C. Barcelona, que de nuevo resultó vencedor. El plan de Sergio Ramos en el tramo final de su carrera es disputar otros tres años al máximo nivel competitivo de Europa y después jugar dos años en estados Unidos.
Su puesto en el banquillo lo ocupó Iñaki Sáez hasta final de temporada. En marzo, el técnico serbio fue cesado y Amorrortu volvió a hacerse cargo del equipo, que cosechó la peor clasificación de su historia en liga hasta ese momento, acabando en 15.º posición. El Athletic acabó la temporada proclamándose campeón de liga por octava vez en su historia. Ya en la temporada 1924-25, sin el técnico inglés al frente, el equipo se proclamó campeón regional como destacado vencedor. Para la temporada 1995-96 volvió a fichar a una joven promesa del equipo donostiarra, en este caso, Joseba Etxeberria y puso como entrenador a Dragoslav Stephanovich. Hizo su debut en la temporada 1995-96 y regresó en la campaña 1997-98, pero en ambos casos descendió al año siguiente. Para la temporada 2010/2011, Llorente venía de ganar la Copa Mundial en Sudáfrica con la selección española. La década de los años ochenta comenzó con la retirada definitiva de la portería de José Ángel Iribar, habiendo jugado 620 partidos con el Athletic y 49 con la selección española.
Ese mismo año debuta en el club el jugador Juan López Hita que cuatro años más tarde recalará en el Sevilla F. C. y llegará a disputar varios partidos con la Selección española de fútbol. Los costarricenses avanzaron a la etapa eliminatoria de la triangular siendo líderes con cuatro puntos. En la Liga 2014-15 se realizó una primera vuelta muy pobre, logrando solo 19 puntos. En la primera parte de la década también llegaron los primeros equipamientos patrocinados, con grandes clubes como el F. C. Bayern de Múnich mostrando nombres de compañías en sus camisetas. En caso de las dobles banderas, indican que vistió dos camisetas nacionales cuando antiguamente estaba permitido. Saliendo del tema marketinero, la camisetas de futbol Real Madrid baratas Tercera presenta un diseño en verde agua con puños y cuello decorados con un toque retro. Destacaron las cinco victorias consecutivas conseguidas en esta segunda vuelta, incluida la victoria ante el Real Madrid C. F. en San Mamés por 1-0, con un golazo de cabeza de Aritz Aduriz. Esta situación se invirtió en la vuelta, donde el Athletic consiguió 36 puntos, su mejor marca en una segunda vuelta desde que la Liga tiene 20 equipos. El Athletic logró finalmente su objetivo de clasificarse para la Europa League, alcanzando la sexta posición con 58 puntos, tienda real madrid los mismos que el Sevilla F. C. (quinto) y el Atlético de Madrid (séptimo).
Esto le sirvió para quedar séptimo con 55 puntos y, gracias a ello, clasificarse para la próxima Liga Europa. Durante los primeros meses, el equipo no terminaba de adaptarse al nuevo estilo y los resultados en liga no eran positivos, aunque en la Liga Europa se habían solventado con éxito los primeros compromisos. En cuanto el equipo comenzó a asimilar el nuevo estilo de juego, los resultados mejoraron notablemente. Con esto, sumado a la consolidación de Fernando Llorente, Javi Martínez y Fernando Amorebieta, la situación del equipo mejoró notablemente y se mantuvo durante toda la temporada en la parte media de la clasificación, sin pasar apuros. Antes de eso, el presidente Fernando Lamikiz, había dimitido tras la fuerte pitada que recibió al término de un partido de Liga. Pero el técnico vasco fue cesado antes de comenzar la nueva pretemporada, debido a una mala relación con el presidente Fernando Lamikiz. Tras el cambio de presidente también hubo cambio de entrenador, así, Joaquín Caparrós fue sustituido por el argentino Marcelo Bielsa.
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